Storebælt Naturmaraton har fire distancer: 5, 10, 21,1 og 42,2 km.
Alle fire distancer har samme mål på havnen i Skælskør, men starter forskellige steder. Der er ikke noget med at løbe den samme rute flere gange. Busser retur til startområderne er inkluderet i prisen.
42,2 km starter på Slagelse Nytorv kl. 9:30 og ruten går først mod Korsør. Efter præcis 21,1 km ramme maratonløberne startområdet for halvmaraton i Korsør Bypark. Starten går kl. 11.30 for halvmaratonløberne. De løber på samme rute mod Skælskør hvor 5 og 10 km løberne starter på Kobæk Strand. De er startet kl. 11.30 hhv. 11.35.