Der findes ingen protokoller om missionshuset før efter 1930, så det er begrænset hvad man ved om de første år. Det første missionshus blev bygget i 1893. Man mener, at initiativtagerne har været pastor M. K. Mogensen og Johan Bang, der var tømrer og indremissionær.
I 1894 kom pastor Windfeld, som var i Nimtofte i 20 år. I hans tid stiftedes KFUK i 1895 og KFUM i 1906.
Lokalarkivet har et billede, hvor præsteparret står omgivet af 14 medlemmer af KFUK. Sygeplejerske Johanne Jensen er nævnt som formand i 1916, da var der 34 medlemmer. Samme år blev det vedtaget, at foreningen hver tirsdag aften skulle have symøde til fordel for hedningemissionen. Der var livlig aktivitet i Missionshuset, da Indre Mission stod stærkt i Nimtofte.
Der er nævnt mange navne som ledere af ungdomsarbejdet. I 1963 blev de to foreninger samlet i en fælles forening, og gartner Erik Simonsen blev leder af arbejdet.
Formanden for Indre Missions Samfund var i mange år tømrer Anton Bang, en søn af Johan Bang. Han ledede også Søndagsskolen bistået af fru Windfeld, Niels Simonsen, slagter Mathiassen og centralbestyrer Ane Mette Nielsen.
Omkring 1930 blev Bang afløst af Anders Rasmussen, Svendstrupgård, der var formand i 25 år. Senere kom Richardt Kahr, Kristian Mathiassen og Erik Lassen.
1935 blev der bygget nyt missionshus. Det kostede 11.398,61 kr. Alt blev betalt af frivilige bidrag, og efter opførelsen blev huset tilskødet Indre Mission i Danmark.
Der blev stadig holdt ugentlige samtalemøder og andre missionsmøder, men tilslutningen blev mindre og mindre, og for nogle år siden blev Indre Missions Samfund i Nimtofte nedlagt og huset solgt til privat beboelse.
